哪些凭证允许用于增值税进项税额抵扣?《财政部、国家税务总局关于在全国开展交通运输业和部分现代服务业营业税改征增值税试点税收政策的通知》(财税〔2013〕37号)第二十三条对纳税人取得的增值税扣税凭证作出了规定，明确“营改增”后只有五种凭证可抵扣增值税进项税额。

自“营改增”试点日起，试点地区增值税扣税凭证由原增值税暂行条例规定的增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书、农产品收购发票、农产品销售发票以及运输费用结算单据调整为增值税专用发票、货物运输业增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书、农产品收购发票、农产品销售发票、运输费用结算单据和中华人民共和国通用税收缴款书，新增加了中华人民共和国通用税收缴款书，主要用于接受境外单位或者个人提供应税服务，代扣代缴增值税而发生的抵扣情况。2013年8月1日起财税〔2013〕37号又调整为增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书、农产品收购发票、农产品销售发票、铁路运输费用结算单据和税收缴款凭证。

“营改增”后五种可抵扣增值税进项税额的凭证分别是如下五种。

(一)增值税专用发票

从货物销售方、加工修理修配劳务或者应税服务提供方取得的增值税专用发票(包括货物运输业增值税专用发票、税控系统开具的机动车销售统一发票，以下简称增值税专票)上注明的增值税额。增值税专票是为加强增值税抵扣管理，根据增值税的特点设计的，供一般纳税人抵扣税款使用的一种发票。增值税专票是一般纳税人从销项税额中抵扣进项税额的扣税凭证，且是目前最主要的一种扣税凭证。增值税专票目前抵扣的期限是自开票之日起180天内进行认证抵扣。

(二)海关进口增值税专用缴款书

在进口货物办理报关进口手续时，纳税人需向海关申报缴纳进口增值税并从海关取得完税证明即海关进口增值税专用缴款书(以下简称海关专缴书)。自2013年7月1日起，增值税一般纳税人进口货物取得的海关专缴书，需经税务机关稽核比对相符后，其增值税额方能作为进项税额在销项税额中抵扣。纳税人取得的海关专缴书，应按照国税函〔2009〕617号文件规定，自开具之日起180天内向主管税务机关报送《海关完税凭证抵扣清单》(电子数据)，申请稽核比对，逾期未申请的其进项税额不予抵扣。

(三)农产品收购凭证

购进农产品，除取得增值税专票或者海关专缴书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。一般有如下4种情况：

1.从一般纳税人购进农产品，按照取得的增值税专票上注明的增值税额抵扣。

2.进口农产品，按照取得的海关专缴书上注明的增值税额抵扣。

3.购进农产品，按照取得的销售农产品的增值税普通发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。

4.从农户收购农产品，按照收购单位自行开具农产品收购发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额，从销项税额中抵扣。目前，农业生产者销售自产农产品是免征增值税的，其不能开具增值税专票，只能开具农产品销售发票。对于小规模纳税人销售农产品也是不得开具增值税专票的，只能开具增值税普通发票。对于零散经营的农户，应由收购单位向农民开具收购发票。上述三种凭证也能作为进项税额扣除。

(四)运输费用扣税凭证

接受交通运输劳务，取得试点地区的单位和个人开具的运输费用结算单据。8月1日全面“营改增”后，按照其开具的增值税专票上注明的进项税额进行抵扣。仅保留铁路运输费用结算单据作为扣税凭证并按7%的扣除率计算的进项税额。8月1日前试点地区小规模纳税人代开的增值税专票上按注明的运输费用(含建设基金，下同)金额和运输费用结算单据按7%的扣除率计算的进项税额(这点已经取消)。

主要有以下情况：

1.8月1日前“营改增”部分试点规定：从非试点地区的单位和个人接受交通运输劳务，非试点地区的单位和个人开具运输费用结算单据(包括由税务机关代开的货物运输专用发票)，受票方可按照运输费用结算单据上注明的运输费用金额和7%的扣除率计算抵扣进项税额;8月1日全面“营改增”后，已取消此项规定，运输费用结算单据(铁路运输费用结算单据除外)，不得作为增值税扣税凭证。铁路运输单据按照运输费用金额和7%的扣除率计算扣除。受票方不再按照取得的增值税专票上注明的价税合计金额和7%的扣除率计算进项税额，修改为直接按增值税专票注明的税额抵扣进项税额。

2.从试点地区的小规模纳税人接受交通运输劳务，小规模纳税人向主管税务机关申请代开增值税专票，受票方可按代开增值税专票注明的税额抵扣进项税额。

3.从试点地区的一般纳税人接受交通运输劳务，按照其开具的增值税专票上注明的进项税额进行抵扣。(适用11%的税率)。

(五)中华人民共和国通用税收缴款书

接受境外单位或者个人提供应税服务，代扣代缴增值税而取得的中华人民共和国通用税收缴款书(以下简称通用缴款书)上注明的增值税额。根据试点实施办法第六条规定，境外单位或者个人向境内提供应税服务的，应由代理人或境内接受劳务的试点纳税人作为扣缴义务人。扣缴义务人按照本实施办法扣缴应税服务税款后，向主管税务机关申报缴纳相应税款，并由主管税务机关出具通用缴款书。扣缴义务人凭通用缴款书上注明的增值税额从应税服务的销项税额中抵扣。

主要有两种方式：

(一)境外单位或者个人在境内提供应税服务，在境内未设有经营机构，以境内代理人为增值税扣缴义务人情况的，由境内代理人按照规定扣缴税款并向主管税务机关申报缴纳相应税款，税务机关向境内代理人出具通用缴款书。境内代理人将取得的通用缴款书转交给接受方。接受方从境内代理人取得通用缴款书后，按照该通用缴款书上注明的增值税额抵扣。

(二)境外单位或者个人在境内提供应税服务，在境内未设有经营机构，且在境内没有代理人，以接受方为增值税扣缴义务人情况的，由接受方按照规定扣缴税款并向主管税务机关申报缴纳相应税款，税务机关向接受方出具通用缴款书。接受方从税务机关取得通用缴款书后，按照该通用缴款书上注明的增值税额抵扣。

几点注意事项

(一)从“营改增”试点地区取得的试点实施之后开具的运输费用结算单据(铁路运输费用结算单据除外)，不得作为增值税扣税凭证。

但有两个例外：一是铁路运输费用结算单据，由于铁路运输劳务目前尚未纳入应税服务征收增值税，因此仍征收营业税，并使用铁路运输单据。铁路运输单据按照运输费用金额和7%的扣除率计算扣除。二是税务机关代开的货物运输业增值税专用发票，新试点规定对原增值税一般纳税人取得的试点小规模纳税人由税务机关代开的增值税专票，受票方不再按照取得的增值税专票上注明的价税合计金额和7%的扣除率计算进项税额，而直接按增值税专票注明的税额抵扣进项税额。

(二)对稽核比对结果为相符的海关缴款书，纳税人应在税务机关提供稽核比对结果的当月纳税申报期内申报抵扣，逾期的其进项税额不予抵扣。

(三)纳税人凭税收缴款凭证抵扣进项税额的，应当具备书面合同、付款证明和境外单位的对账单或者发票。资料不全的，其进项税额不得从销项税额中抵扣。

(四)增值税扣税凭证不符合法律法规，其进项税额不得抵扣。纳税人取得的增值税扣税凭证不符合法律、行政法规或者国家税务总局有关规定的，其进项税额不得从销项税额中抵扣。